Во время установки новой версии, могу посоветовать поставить галку Activate TC Settings. С ним изменится раскладка панелей в Visual Studio (возможно, вам это не понравится), без него — придется ковыряться в дебрях Visual Studio в поисках всех этих кнопок и панелей TwinCAT и вытаскивать их вручную (возможно, это вам не понравится).
После установки нового билда под Windows 10 Home 1803, TwinCAT у меня, несмотря на включенную опцию автостарта сервиса, так и не запустился. Пришлось вручную открыть "Службы" Windows и запустить TcSysSrv (TwinCAT3 System Service). После этого все отлично заработало.